净化工程洁净室给排水管道敷设尽量保证不积灰。为避免洁净室因粉尘污染量大而敷设给排水管道，净化工程中必须尽量采用室外敷设或隐蔽安装，以尽量减少室内管道的清洁。

敷设管道前，必须对给排水管道进行消毒，管道内必须安装消毒过滤器和水消毒装置。河北净化工程洁净室安装的给水干管和排水立管应进行隐蔽和保护。当管道穿过墙壁或地板时，应预留套管，套管比管道直径大两倍，管道接口不应位于套管内。套管与管道之间的缝隙应用硅橡胶密封胶密封，穿越火区的管道也应设置套管，套管与管道之间的空间应用不燃或阻燃材料密封。

在隐蔽位置设计刚性检修门阀门和排水检查口，高出地漏安装5~10mm。如果需要连接卫生洁具和供水管道的相关设备，应保证密封性。施工应严格按照国家建筑设计和施工标准进行。

在绿色医院净化工程洁净室给排水设计过程中，为了促进资源节约、节能减排，还需要设计专门的污水处理系统进行污水过滤净化。

在净化工程的洁净室运行中，处理后的污水可以用于一些设施，不仅可以减少水资源的污染，还可以提高水资源的二次利用率。